Você pode instalar o pacote do kernel de baixa latência com o Centro de Software ou usando o APT:
sudo apt-get install linux-image-lowlatency
Se o uso do kernel de baixa latência não funcionar para você, você tem um problema diferente.
Se você quiser torná-lo permanente, veja Como faço para fixar os kernels de baixa latência para que o apt não seja atualizado com um novo kernel genérico?