Uma maneira que você pode realizar é com o triger no meu sql que atualizará o campo adicional postfix_pass no db do usuário owncloud toda vez que um novo usuário for criado ou a passagem do usuário for alterada.
Esta não é a melhor solução por causa da criptografia sha do campo de passagem de usuários postfix.
No postfix, você configura o auth.cfm para autenticar-se no banco de dados do usuário owncloud, mas com o passe do campo adicionado.
Esta pode ser uma solução rápida até que você encontre uma solução para usar a tabela original do usuário owncloud para autenticação pós-fixada.