Tive o mesmo problema com o mysql-server-5.6 e esta solução me ajudou:
launchpad: Bug # 392051: Comando logger [kármico] não encontrado
Basicamente, o programa logger
ficou confuso;
Ele pode ser recriado ao reinstalar o pacote bsdutils
:
apt-get --reinstall install bsdutils
ou
aptitude reinstall bsdutils