Primeiro, no diretório de mudança de terminal para a pasta MATHWORKS_R2012A.
cd /media/MATHWORKS_R2012A
Em seguida, altere a permissão no instalador para que o root possa executá-lo.
sudo chmod +x ./install
Agora você pode executar o instalador. Não tenho certeza se você precisa das opções extras que você tem em sua pergunta ou não, mas será assim:
sudo ./install