Inicialize com o Windows e, no cmd, digite powercfg -h off para desabilitar a hibernação e tente inicializar com o Ubuntu. Isso corrigirá.
Você também pode consertar isso no Ubuntu:
Use sudo ntfsfix /dev/sdXY , em que XY é o nome da partição. ex: sda4. use o gparted para encontrar o nome da partição.