Fácil. Quando você for instalar, BOOT INTO AO LIVE DESKTOP .
Em seguida, vá para GParted (Alt + F2 gparted).
Selecione sua unidade C e DELETE. Clique em aplicar. Vai demorar um pouco.
Agora, crie uma nova partição no "espaço vazio". Certifique-se de que é EXT4.
Em seguida, aplique essas alterações. Quando terminar, feche o GParted.
Agora, inicie o instalador do Ubuntu. Quando lhe perguntar onde instalar o Ubuntu, entre em "Advanced Mode" e selecione o espaço EXT4. Diga para montar isso como /. Selecione sua unidade D e diga-a para montar como algo como / backup (ou o que você quiser). Certifique-se de que a caixa de seleção de formato NÃO esteja marcada. Em seguida, continue com a instalação.
Se tudo der certo, parabéns! Se não, recupere essa partição e rápido!
Normalmente, você SEMPRE deseja ter backups em um disco externo. Apenas mais seguro (e menos chance de limpeza acidental).