Não há diferença entre a inicialização dupla e a tripla (ou quádrupla, etc.), pelo menos quando o sistema operacional que está sendo instalado é o Linux - você apenas prepara uma partição vazia e instala seu sistema operacional lá.
Supostamente, o GRUB será reinstalado para que seu segundo estágio esteja na partição do último sistema operacional instalado, mas ele deve encontrar todos os outros sistemas operacionais e adicioná-los ao menu da mesma forma.
Não sei como a reparação do MBR com o DVD do Windows se relaciona aqui - você não está usando o gerenciador de inicialização do Windows como seu gerenciador de inicialização primário, está?