Eles mudaram o kernel de vmlinuz
para vmlinuz.efi
do release 12.04.1. Portanto, a única maneira de contornar isso é usar a revisão corrigida 273 de wubi.exe
para o Ubuntu 12.04.2 aqui: link
Ele foi corrigido e compilado, mas a correção só foi lançada para o 13.04 e não para o 12.04.2 por algum motivo. (Veja link )