Para poder atualizar o Virtual Box para um lançamento maior (por exemplo, 4.2.x para 4.3.x), teremos que remover primeiro os módulos e aplicativos do kernel de uma versão antiga. Isso não afetará nossas máquinas virtuais.
No caso de você ter instalado a partir do Repositório Oracle você pode - depois de ter atualizado o cache do apt - apenas execute os seguintes comandos:
sudo apt-get purge virtualbox-4.2
sudo apt-get install virtualbox-4.3
Após a atualização, também teremos que baixar e reinstalar os pacotes de extensão no caso de precisarmos deles. Também é aconselhável atualizar as adições de convidados em nossas máquinas virtuais.