sim, existe uma ferramenta e você pode fazer isso a partir da linha de comando. para fazer isso você tem que instalar o aplicativo imagemagic.
sudo apt-get install imagemagic
depois, vá para o diretório onde você tem a imagem.
convert <yourimage_source>.jpg -rotate 90 <yourimage_sourcename>.jpg
O comando acima irá girar a imagem em 90 graus.
Se você gostaria de realizar tal ação para um monte de imagens, faça este comando após o cd no diretório onde você tem imagens.
for file in *.png; do convert $file -rotate 90 rotated-$file; done
espero que ajude.