Você precisa desmontar a placa através do Utilitário de Disco, depois formatar cada partição na placa para criar uma partição , depois formatar a própria placa e criar uma nova partição como preferir.
Algumas pessoas lutam com a lógica do Disk Utility, caso em que você pode usar o Windows para formatá-lo como de costume e conectá-lo novamente à sua máquina Ubuntu.