É porque as configurações específicas do usuário são armazenadas no seu diretório inicial e não são removidas. Tente encontrar o diretório bluefish no diretório ~/.config ou ~/.bluefish em casa e removê-lo para redefinir a preferência do usuário.
Atualização: Como Zanna mencionou no comentário (que agora é removido), é .bluefish em casa.