Eu quero usar o sistema de arquivos como todas as unidades do disco rígido sem instalar o Ubuntu apenas executando via USB.
Se você quer dizer executar o Ubuntu a partir da unidade flash USB, então você pode sim. Isso vai funcionar bem.
Mas se você quer dizer instalar o Ubuntu em um flash drive, então você pode criar uma persistência USB. Você pode criá-lo usando o criador do Live USB.
Para mais informações, clique Aqui
tenha em mente que pode ser um pouco lento
Sim, quando você executa o Ubuntu a partir de um cartão de memória USB, você obtém toda a funcionalidade do Ubuntu - incluindo o acesso a sistemas de arquivos locais. Como tenho o Ubuntu no meu chaveiro, consegui ajudar os usuários do Windows a recuperar arquivos em mais de uma ocasião.