Recentemente, configurei minha barra Unity Launcher para auto-ocultar e para ser transparente, usando as ferramentas de configuração do Compiz (ccsm, no terminal). Eu não usei 'Unsettings' para fazer isso, pois, por qualquer motivo, não podia deixar meu lançador transparente no mínimo. Enquanto o lançador auto-esconde corretamente, de acordo com minhas configurações, ele deixou para trás uma grande barra colorida (o mesmo tamanho do lançador) em seu lugar. Essa barra não desaparece a qualquer momento, exceto quando uma janela é arrastada por ela, ponto no qual ela desaparece completamente, ao redor da janela, e reaparece quando a janela deixou sua premissa.
Estou tentando me livrar dessa barra colorida; alterar o plano de fundo da área de trabalho não o corrigiu e fazer logout e login novamente também não o corrigiu.
unity --reset deve redefinir sua configuração de unidade se você estiver no release 12.04 ou anterior. Não tenho certeza qual é o comando para 12.10.
Como uma alternativa ao ccsm - que não é um programa ruim, mas parece causar problemas para algumas pessoas - o aplicativo MyUnity está disponível no Centro de Software e permite alterar o comportamento do inicializador, incluindo ocultamento automático e transparência.