Consegui recuperar meus espaços de trabalho: D
A solução é:
1.- Exporte sua configuração do compiz pelo ccsm (se você não tiver apenas o sudo apt-get install ccsm). 2.- Encontre a seção [core]. 3.- Defina a quantidade de espaços de trabalho com:
s0_hsize = 2
s0_vsize = 2
4.- Importe sua configuração de volta ao compiz. 5.- Aproveite seus espaços de trabalho.
Isso tem que ser feito dessa maneira porque o ccsm não tem algumas configurações ... essa é uma delas.