Nós só podemos supor o que aconteceu entre o ponto em que o USB funcionou perfeitamente e o problema que você tem com ele agora. Você poderia tentar fazer outro USB inicializável, talvez com uma versão diferente do Ubuntu. Supondo que não houve nenhuma alteração de hardware ou alterações no bios / grub, não consigo encontrar muitos outros conselhos para dar sem mais informações.