Se você está procurando uma alternativa para o Tomboy, eu sugiro: Zim
No Windows existe um aplicativo chamado Post-It! Notas. É um programa muito completo: permite usar o lembrete, mostrar as notas que foram abertas antes de desligar o PC, gerenciador de tarefas, ...
Existe uma aplicação de notas completa para o Linux?
Aqui estão alguns aplicativos de anotações que funcionam no Ubuntu. Eu acredito que alguns deles têm listas de tarefas e lembretes. não sei sobre a parte de desligamento, mas alguns são extensíveis para que os recursos possam ser adicionados.
Wunderlist
Funciona no iPhone, Android, computador desktop ou on-line.
Leia mais: link
KeepNote
Um bom sistema de anotações com suporte a imagens.
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tiddlywiki
Apenas uma única página HTML javascripted que você personaliza e usa com seu navegador e fora de você, a vantagem disso é que você obtém tabelas e imagens e outras coisas sofisticadas em HTML. Muitas variações desse sistema também possuem plug-ins que você pode usar para estendê-las.
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Notecasepro mantém todas as suas anotações em um arquivo, recurso de segurança, suporte a imagens. A versão mais antiga deste, 1.9.8 chamado notecase, está disponível nos repositórios 10.10, eu não sei se este é o caso com versões mais recentes do Ubuntu. você pode querer experimentar qualquer um deles.
home page: link
Modo Org do Emacs
Muito bom recurso de tabela com texto puro, boa saída para Latex, Até mesmo cálculos de planilha podem ser feitos. Pode ser instalado a partir de repositórios, basta procurar pelo modo de organização no gerenciador de pacotes.
Alguns tutoriais para a organização: link
wiki da área de trabalho do zim
Altamente recomendado e devo adicionar, meu favorito.
Suporta a vinculação no local ou a importação (cópia para a pasta de notas) de imagens como .png, .jpg e outros formatos de bitmap comuns também suporta o formato vetorial .svg, para que você possa vincular ou importar todos os desenhos .svg que desejar referência em suas anotações. Excelente exportação de látex e html.
Com o sistema de latex e o dvipng instalado, um plugin de equação de látex está disponível para incluir boa matemática em suas anotações.
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Zim em ação: link
Modo Org é um modo do Emacs para anotações e muito mais. Ele pode fazer tudo o que o Tomboy e o Gnote podem e também pode vincular notas a um calendário e oferecer suporte à exportação para o LaTeX.
Primeiro eu usei as notas do Gnome, mudei para o Tomboy, depois para o Gnote e finalmente para o Org-mode. Demora um pouco mais de tempo para aprender o modo de organização, mas depois de você ter aprendido você vai achar mais poderoso e eficiente .Para instalá-lo:
sudo apt-get install org-mode org-mode
Você pode usar Sticky Notes. Veja esta questão relacionada para detalhes: