Então, estou experimentando o GBrowse, pois usaremos isso mais tarde.
Mas então, estou recebendo isso
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256000 features loaded in 230.29s ( 1.19s/1000 features)...
Building object tree... 6.78s.47s
Loading bulk data into database.../tmp/feature.12240
DBD::mysql::db do failed: The used command is not allowed with this MySQL version at /usr/local/share/perl/5.14.2/Bio/DB/SeqFeature/Store/DBI/mysql.pm line 571, <GEN0> line 256232.
-------------------- EXCEPTION --------------------
MSG: The used command is not allowed with this MySQL version
STACK Bio::DB::SeqFeature::Store::DBI::mysql::_finish_bulk_update /usr/local/share/perl/5.14.2/Bio/DB/SeqFeature/Store/DBI/mysql.pm:571
STACK Bio::DB::SeqFeature::Store::finish_bulk_update /usr/local/share/perl/5.14.2/Bio/DB/SeqFeature/Store.pm:1505
STACK Bio::DB::SeqFeature::Store::GFF3Loader::finish_load /usr/local/share/perl/5.14.2/Bio/DB/SeqFeature/Store/GFF3Loader.pm:349
STACK Bio::DB::SeqFeature::Store::Loader::load_fh /usr/local/share/perl/5.14.2/Bio/DB/SeqFeature/Store/Loader.pm:354
STACK Bio::DB::SeqFeature::Store::Loader::load /usr/local/share/perl/5.14.2/Bio/DB/SeqFeature/Store/Loader.pm:243
STACK toplevel bp_seqfeature_load.pl:103
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Eu tentei fazer o que é dito aqui: link , também em a parte link
If you use LOAD DATA LOCAL in Perl scripts or other programs that read the [client] group from option files, you can add the local-infile=1 option to that group. However, to keep this from causing problems for programs that do not understand local-infile, specify it using the loose- prefix:
Então estou desesperado agora - existe tal coisa no Ubuntu? Porque, como eu vejo no Windows, você pode facilmente editar no Visualizador de snap-in Serviços. O que pretendo fazer é adicionar o parâmetro --local-infile=1 ao executável mysqld quando o script / programa que inicia o serviço MySQL for chamado.