Se você instalar o Windows depois de instalar o Ubuntu, o Windows substituirá o bootloader do Grub pelo seu próprio gerenciador de inicialização, que removerá o menu de inicialização quando você ligar o PC, removendo a capacidade de inicializar o Ubuntu.
Embora você possa sempre restaurar o grub, eu sempre recomendaria a instalação do ubuntu após o Windows. Whaty eu recomendo agora, é reinstalar o Windows em toda a unidade, em seguida, reinstalar o Ubuntu e selecione "instalar o Ubuntu ao lado do Windows" ao instalar o Ubuntu eo instalador do Ubuntu vai deixar você escolher quanto espaço do Windows você quer Ubuntu e ele vai fazer todo o material sujo necessário para obter o boot duplo funcionando corretamente.