- Tem certeza de que o arquivo não pertence ao Xubuntu. Você está inicializando do USB e tentando excluir arquivos do USB?
- Tente excluir com Shift + Del. Exclui diretamente sem mover as coisas para o lixo (que aparentemente está faltando).
- Tente excluir da linha de comando (se isso não funcionar, poste a mensagem de erro que aparece).