Já tentou abrir as configurações do sistema, selecionar "aparência", abrir a guia "comportamento" e "Restaurar comportamentos padrão"?
Se não funcionar tente isto:
Pressione Ctrl + Alt + t
Executar unity --reset
Se ainda assim não funcionar, tente isto:
sudo apt-get install dconf-tools
dconf reset -f /org/compiz/