Primeiro, o programa de certificação da Microsoft exige que os usuários devam desativar a Inicialização Segura em computadores x86 / x86-64 com o logotipo do Windows 8. Assim, quase certamente existe uma maneira de fazer isso. Infelizmente, não há padronização nas interfaces de usuário sobre esse assunto, então você pode precisar ir mais fundo ou ligar para o suporte técnico para descobrir como fazer isso. Se você precisar ligar para o suporte técnico, não se esqueça de reclamar e fazer o acompanhamento com uma carta.
Em segundo lugar, o Ubuntu 12.10 vem com suporte a Boot Seguro, portanto é teoricamente possível instalá-lo em um computador que usa o Secure Boot, mesmo sem desativar esse recurso. Eu digo "teoricamente" porque este suporte é muito novo, e algumas pessoas parecem ter problemas com ele. O Ubuntu 12.04 não oferece suporte à Inicialização Segura, portanto, instalá-lo com o Secure Boot ativo é muito mais difícil. (Não é impossível, mas é tão difícil que não é prático para nada além de especialistas.)