Um arquivo .vdi (disco virtual) é uma imagem de disco usada pelo VirtualBox. Você pode pensar nisso como representando uma peça do seu hardware virtual - o disco rígido.
Se você tiver apenas uma peça da máquina, essa é a mais importante - afinal, é uma máquina virtual e as novas peças virtuais não custam nada.
Abra a caixa virtual. Crie uma nova máquina virtual. Quando você chegar ao ponto em que for perguntado sobre seu disco rígido, especifique esse arquivo .vdi como o disco. Ou crie uma máquina virtual e, depois, adicione-a como um disco e remova o disco virtual não utilizado que foi originalmente criado para ela. (Se você fizer dessa forma e quiser excluir o novo disco vazio, certifique-se de não excluir o arquivo .vdi que contém seus dados por acidente!)
A propósito, se você conseguir recuperar toda a máquina virtual (ou seja, os outros arquivos dela também), você poderá importá-la para o VirtualBox abrindo o arquivo da máquina virtual (ending em .xml ).
Sua pergunta pode ser considerada fora do tópico, já que você está perguntando como reconstruir uma VM do VirtualBox no OS X. Qual sistema operacional a VM está executando (nesse caso, o Ubuntu) é irrelevante, então isso não é É realmente sobre o Ubuntu. Por outro lado, o VirtualBox também é um software Ubuntu - para usuários do Ubuntu que querem ter máquinas virtuais. As respostas às suas perguntas também não são específicas do sistema host, então suponho que isso possa ser considerado no tópico, e é por isso que publiquei essa resposta. Sites melhores para ele podem ser Peça diferente e Superusuário , mas por favor não tenha a mesma pergunta aberta em mais de um site da SE de cada vez.