Se eu estou lendo isso corretamente, resolvendo o problema de gerenciando dual telas também resolveriam o problema inicial que você descreve.
No passado (antes do Unity), era possível usar toda a minha área de trabalho sem menus.
Eu usei um aplicativo de inicialização rápida para executar meus programas e usei alguns dos gerenciadores de janelas do compiz para alternar entre as minhas janelas. Agora eu estou meio preso com o menu no topo e a unidade à esquerda (que eu posso ocultar automaticamente, mas isso estraga tudo com dois monitores lado a lado).
Existem hacks e utilitários para fazê-los desaparecer, mas qual seria a maneira menos intrusiva? Não posso permitir que meu Ubuntu fique instável.
Se eu estou lendo isso corretamente, resolvendo o problema de gerenciando dual telas também resolveriam o problema inicial que você descreve.