Você pode usar xdg-user-dirs para configurar diretórios de usuários. link
Seus diretórios são armazenados em ~/.config/user-dirs.dirs
xdg-user-dirs pode ser lida em link
Eu não gosto dos arquivos padrão do Nautilus (a ordenação por tipos de dados - Imagens, Música, Vídeos, Documentos, etc.), como posso alterar isso ou posso alterar essa ordem sem ter problemas com vários softwares ou o Ubuntu? um?