Pacotes que precisam solicitar uma reinicialização do sistema podem chamar /usr/share/update-notifier/notify-reboot-required
, isso irá atualizar alguns arquivos que farão o que você precisa (configurando o indicador do sistema para vermelho e pedindo ao usuário para reiniciar a instalação) .
Você pode ver o pacote do pacote do kernel para mais detalhes, ou esta resposta também pode ajudar:
Como posso saber o que pacote requer uma reinicialização do meu sistema?