Edite esta linha own_window_type desktop para own_window_type normal . Na maioria dos casos, isso funcionará. Caso contrário, altere a linha para own_window_type dock .
Para mais configurações:
Estou executando o 12.04 e segui as instruções aqui:
É possível ter um diferente plano de fundo para cada espaço de trabalho?
para obter um papel de parede diferente por área de trabalho. Funciona desabilitando o desenho do desktop nautilus e habilita o plug-in de parede do Compiz. Mas desde que eu fiz isso meu conky não aparecerá mais.
Aqui está a parte relevante:
background yes
use_xft yes
xftfont Sans:size=10
xftalpha 0.9
update_interval 1.0
total_run_times 0
own_window yes
own_window_type desktop
own_window_title "conky"
own_window_hints undecorated,below,sticky,skip_taskbar,skip_pager
double_buffer yes
minimum_size 180 5
maximum_width 200
draw_shades no
draw_outline no
draw_borders no
draw_graph_borders no
default_color white
default_shade_color red
default_outline_color green
alignment top_right
gap_x 12
gap_y 28
no_buffers yes
uppercase no
cpu_avg_samples 2
override_utf8_locale no