Você instalou o Wubi recentemente. Você pode tentar desinstalá-lo para ver se o erro desaparece. (Ou você não consegue desinstalar o software no Windows, como parte deste problema?)
Se isso não acontecer, isso não prova que o Wubi não é responsável. Mas se o faz ir embora, então isso praticamente prova que o Wubi é responsável (mesmo que apenas desencadeando algum bug no Windows). Nesse caso, isso deve ser relatado como um bug contra o projeto Wubi no Launchpad .
Se você decidir desinstalar o Wubi e o problema desaparecer, então uma solução alternativa pode ser a instalação do Ubuntu da maneira padrão , ao lado de dentro do sistema Windows.