eu recomendo iniciar a partir de DVD ao vivo ou qualquer dispositivo com o sistema Ubuntu e re-gerenciar o disco rígido com o aplicativo gparted, como você tem disco rígido limpo tentar formatá-lo e verificar se há erorrs
use o tutorial para criar partições daqui Como instalar o Side by Side Boot em Windows XP ou apenas criar partições como mostrado neste vídeo, é russo, mas você não precisa entender as palavras, apenas veja o cara clicando e faça