Parece que você instalou o WUBI, o instalador do windows, na desinstalação do Windows. Ele também desinstalou o ubuntu install. Desde que você reinstalou o Ubuntu, tente usar o boot-repair. link
Eu estava tendo problemas com o meu Windows 7 e não pude acessar o roteador, então eu instalei o Ubuntu 12.04 LTS para ver se eu poderia fazer network sobre isso, e eu pude.
Depois de muito barulho, decidi que o melhor curso de ação seria reinstalar o Windows 7, mas perdi a opção de inicializar no Ubuntu. O fato é que eu realmente gostei do Ubuntu e queria continuar usando-o ao lado do Windows. Decidi apenas reinstalar o Ubuntu do CD, perdendo assim todos os extras que adicionei.
Eis que o PC ainda inicializa direto no Windows 7 sem a opção de entrar no Ubuntu, o que posso fazer?
Parece que você instalou o WUBI, o instalador do windows, na desinstalação do Windows. Ele também desinstalou o ubuntu install. Desde que você reinstalou o Ubuntu, tente usar o boot-repair. link