A julgar pela sua descrição, parece que o MBR do seu disco rígido (o primeiro setor, usado para inicializar a partir daquele disco rígido) aponta para o gerenciador de inicialização do Windows. O bootloader do Windows é incompatível com a maioria dos sistemas operacionais, além do próprio Windows. Isso geralmente acontece quando você instala o Windows após o Linux, ou se você "reparar" o Windows.
O que você deseja é um gerenciador de inicialização compatível com o Linux & amp; Janelas. Por exemplo, o GRUB, o bootloader usado por padrão pelo Ubuntu.
Atualizar / reinstalar o GRUB, portanto, deve corrigir seu problema.
Esta resposta explica particularmente bem como proceder: link
Você precisará de um CD USB ou de instalação inicializável.