Certifique-se de estar usando o JDK oficial, fornecido pela Oracle, não o OpenJDK, que vem com o Ubuntu por padrão. O Eclipse não funciona muito bem com o OpenJDK - eu suspeitava que esse também poderia ser o caso do Netbeans.
Para verificar sua versão do Java, abra o terminal e tente isto:
java -version
Você deve ver algo assim:
java version "1.7.0_03"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.7.0_03-b04)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 22.1-b02, mixed mode)
em vez disso:
java version "1.7.0_03"
OpenJDK Runtime Environment (IcedTea7 2.1.1pre) (7~u3-2.1.1~pre1-1ubuntu3)
OpenJDK 64-Bit Server VM (build 22.0-b10, mixed mode)