Você precisaria criar um .iso personalizado para modificar esses arquivos.
Veja: Posso criar um ISO do Ubuntu a partir de um manifesto
O sistema de arquivos raiz é compactado para caber na iso, mas o casper monta o sistema de arquivos ro (rofs).
Você pode usar a persistência, mas a persistência ocupa ainda mais espaço (cow).
Como você fez o seu usb? O iso deve demorar apenas 700 Mb ou mais, você tem outros dados armazenados no usb? Persistência?