Depois de receber alguns conselhos úteis da lista de e-mails do Scribus, encontrei a solução para o meu problema. A versão do Scribus nos repositórios oficiais do Ubuntu não possui a opção Incorporar PDF / EPS ativada. Em vez disso, os repositórios do Scribus do link precisam ser ativados. Depois de baixar o pacote atualizado do Scribus com os repositórios Oneiric ativados, o PDF / EPS embutido funciona.