Como o GRUB está instalado no disco usb não no disco rígido, recomendo que você inicialize o live usb, instale a ferramenta boot-repair e reinstale o grub no disco rígido. :)
Leia com atenção - > link
Instalei o Windows 7 hoje e logo após instalar o Ubuntu 12.04 ao lado dele.
Agora, depois de reiniciar a máquina, ele vai direto para o Win7 sem me perguntar nada no menu de inicialização que o sistema operacional deve carregar.
No Windows eu posso ver que as partições do Ubuntu ainda estão lá.
Obrigado