Isto acontece porque em Natty Super / Mod4 é um atalho para o painel Unity. Você pode mudar isso no Compiz.
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Instale o compizconfig-settings-manager pacote.
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Pressione Alt + F2 , digite
about:config
e pressione Enter para abrir a configuração do Unity. -
Altere o atalho para a tecla para mostrar ao lançador como quiser para liberar sua chave Super :
Neste exemplo eu mudei de Super para Super + L
Agora, sua chave mod está livre para usar como quiser.