Você não pode desativar a placa Nvidia por padrão, ela está conectada à CPU Intel. Você teve problemas de 3D porque o cartão não pôde ser usado, mas os drivers ainda estavam carregados, impedindo que o módulo Mesa OpenGL fosse carregado. Isso quebra efeitos gráficos, recursos 3D e tal. A desinstalação do driver nvidia reverte esse comportamento.
Seu comando sudo echo
falhou devido a Redirecionar a saída usando 'sudo'
O Optimus não é suportado pela nVidia para Linux. Para uma explicação mais longa e soluções possíveis, consulte Uma tecnologia NVIDIA GeForce com Optimus é suportada pelo Ubuntu?