Não há realmente nenhum software para "bloqueio de pasta", mas você pode conseguir isso através de permissões e, opcionalmente, listas de controle de acesso (você tem que habilitar isso em fstab adicionando "acl" à lista de opções de montagem para seu disco unidade, e instalando eicel).
Usar as permissões padrão do Unix em suas pastas é uma maneira simples, mas eficiente, de bloquear pastas sem software.