Eu tenho o mesmo problema aqui, mas estou usando esta solução alternativa:
Vá para "Configurações do sistema > Entrada de texto". Em "Fontes de entrada a serem usadas", adicione o layout do teclado, se ainda não existir, e mova-o para o início de todos os layouts que você já possui. Ou, se preferir, você pode simplesmente apagar todos os layouts que você não precisa e manter apenas o que você quer (foi o que eu fiz aqui).
Agora, abra os "Aplicativos de inicialização", clique em Adicionar e faça o seguinte:
% bl0ck_qu0te%
Sobre o nome:
Você pode usar o que quiser.
Sobre o comando:
Depois que o sistema for iniciado, ele aguardará por 5 segundos e, em seguida, alterará o layout do teclado para o padrão (aquele que você moveu para o topo na caixa "Fontes de entrada a serem usadas").
Clique em "Salvar" e depois em "Fechar". Agora, toda vez que você iniciar o Ubuntu, o layout do teclado será definido corretamente.
Espero que seja útil. Felicidades. :)
brunces