Não tenho certeza se é isso que você quer dizer, mas você pode tentar gksu synaptic .
Como iniciar um programa com sudo privilege no Unity? Estou usando o Ubuntu 11.04.
Eu usei este comando, mas não funciona:
sudo synaptic
Não tenho certeza se é isso que você quer dizer, mas você pode tentar gksu synaptic .
Como alternativa, use o terminal que você pode - como eu faço - manter na unidade inicial. Eu acredito que é uma coisa de gosto se você usa o gksu ou o terminal.