O Startup Disc Creator só faz a instalação do ISO9660 em uma única unidade de partição.
O Yumi Multiboot USB fará várias instalações persistentes na mesma partição, mas só é executado no Windows.
O MultiBootUSB também fará várias instalações persistentes na mesma partição e há uma versão do Linux.
Você pode dividir uma unidade GTP em partições e fazer uma instalação completa de um sistema operacional para cada partição usando "somerthing else". O Grub deve se organizar automaticamente.
Editar:
Um dos meus multibooters favoritos é fazer um drive com mkusb, usando defaults, sobrescrever a partição ISO9660 e a partição casper-rw com uma partição FAT32 para pastas persistentes, adicionar um arquivo casper-rw e um arquivo home-rw a cada nomeada exclusivamente pasta persistente e criar uma pasta na partição NTFS rotulada "iso" para o ISO, em seguida, adicionar algumas ISO's. Edite o usbboot / boot / grub.cfg para montar os arquivos ISO em loop. Inclua: persistent persistent-path=/<persistent-folder-name> se você quiser persistência. A persistência é limitada a 4 GB para cada arquivo casper-rw e 4 GB para o arquivo home-rw.
Existem algumas variações neste método.
Todos os itens acima funcionaram para mim com BIOS e UEFI.
Editar 2: unidade de instalação do Linux
Multibootin com UNetbootin. Use o GParted para criar uma unidade flash msdos com tantas partições FAT32 quanto o SO (~ 2GB cada). O tamanho da partição pode ser aumentado para atender aos requisitos de persistência. Sinalizar a primeira partição, (sdb1), como inicialização. Use o UNetbootin, (655), para instalar um sistema operacional em cada partição, adicionando persistência conforme necessário, copie chain.c32 do pacote syslinux 4.07 para a raiz da primeira partição. Abra a primeira partição e faça uma cópia do syslinux.cfg como syslinux2.cfg. Edite o syslinux.cfg original da seguinte forma:
default menu.c32
label boot_hd0_1
menu label linuxmint 18.2
config syslinux2.cfg
label boot_hd0_2
menu label Ubuntu 16.04.3
com32 chain.c32
append hd0 x
em que x é o número da partição do syslinux. Pode precisar ser modificado para UEFI Incluirá um resumo gráfico desse método como uma resposta separada.

mkusbusapadrõesdepersistência
ConsoleDUS
GPartedAntes
Gparteddepoisde
Partiçãodepersistência
Pastadepersistência
PastaISO
ConteúdodapastaISO
LocalizaçãodoGRUB
grub.cfg
sudoparted-ls/dev/sdb
sudo lsblk -f / dev / sdb 
UseoUNetbootin655parainstalarsistemasoperacionaisempartiçõesdisponíveis.
Instalenaprimeirapartiçãoporúltimooudefinaosinalizadordeinicializaçãoparaaprimeirapartiçãomanualmente.
CopieChain.c32dopacoteSyslinux-4.07pararaizdaprimeirapartição.4.03chain.c32nãofunciona.
Copiesyslinux.cfgcomosyslinux2.cfg
Substituaoconteúdodosyslinux.cfgoriginal,comomostrado,adicionandoumaentradachainloadparacadaSO.
sudoparted-ls/dev/sdb
sudolsblk-f/dev/sdb
Esqueça o syslinux2.cfg e edite o syslinux.cfg original para incluir o comando chain loading para outro SO.