Se você tiver gráficos comutáveis (integrados e discretos), o Ubuntu usará os gráficos integrados, a menos que haja um driver instalado para os gráficos discretos.
No seu caso, você tem gráficos Intel e AMD e o Ubuntu está usando os gráficos Intel porque você não possui drivers proprietários. Para usar a placa AMD, você teria que instalar o fglrx .
Infelizmente para você, fglrx não é mais suportado no 16.04, nem funcionará se instalado. Existe um driver proprietário que está em desenvolvimento, mas não acredito que seja muito estável.
Por enquanto, você terá que esperar até que um driver AMD proprietário saia para o 16.04 ou faça o downgrade para o 14.04 ou 15.10, para poder usar o fglrx .