Você precisa dar o bit executável.
Execute este comando no terminal ( ctrl + alt + t ):
sudo chmod +x yourfle.jar
Então você pode executá-lo normalmente com:
java -jar yourfile.jar
Como eu poderia ignorar arquivos bloqueados de fontes "não confiáveis"? Eu estou usando 15.10 (Wily Werewolf)
Você precisa dar o bit executável.
Execute este comando no terminal ( ctrl + alt + t ):
sudo chmod +x yourfle.jar
Então você pode executá-lo normalmente com:
java -jar yourfile.jar
Digite no terminal:
sudo chmod +x file.jar
Isso deve resolver o problema.
Embora a versão do terminal já postada seja mais fácil, você também pode clicar com o botão direito do mouse em .jar em um explorador de arquivos vá em Permissões e selecione permitir a execução do arquivo como programa.