Ou o seu professor foi mal informado ou o comentário foi usado em um contexto diferente do que você lembra. Em um desligamento controlado, as chances de qualquer tipo de dano ou corrupção são extremamente pequenas. É durante desligamentos forçados e difíceis que a chance de dano ocorre - geralmente para abrir arquivos e para a estrutura de diretórios do disco. Isso é aplicável a qualquer sistema operacional, não apenas a sistemas baseados em Linux.