Se você quiser fazer isso a partir de um console, é bem simples. Tudo o que você precisa fazer é colocar em um shell de root e desabilitar as fontes problemáticas:
sudo add-apt-repository -r ppa:pinta-maintainers/pinta-stable
sudo add-apt-repository -r ppa:pipelight/stable
Por fim, desative a origem do CD-ROM:
sudo nano /etc/apt/sources.list
Encontre a linha que começa com deb:cdrom
(deve estar no topo) e coloque um #
no início da linha.
Quando terminar, recarregue o cache do Apt:
sudo apt update
Esse problema aconteceu porque o Ubuntu estava procurando por fontes de software inexistentes, não foi capaz de encontrá-los e, portanto, não conseguiu saber onde alguns pacotes estão (ou não estão neste caso). Isso quase sempre acontece após as instalações.