Os 3 aplicativos mais comuns sobre os quais você ouvirá quando falar sobre ajustes no Gnome / Unity serão gconf-editor , dconf-editor e ccsm .
Você pode encontrá-los no Software Center e instalá-los a partir daí.
As duas primeiras ferramentas irão configurar diferentes (algumas vezes não tão diferentes, pense nisso como um caminho que leva ao mesmo objetivo) aspectos da sua configuração do Gnome e o último é importante para configurar sua configuração do Unity / Compiz.
gconf-editor armazena seus dados em arquivos XML em /etc/gconf/
dconf-editor usa arquivos chamados de arquivos-chave armazenados em /etc/dconf/db/
ccsm armazena seus dados em arquivos XML nas pastas ~/.gconf/apps/compiz e ~/.gconf/apps/compizconfig .
Qualquer um destes pode ser lido e editado com um editor de texto simples ( nano , gedit , etc.), mas com certeza é muito trabalhoso. Use as ferramentas apropriadas para editar esses arquivos e isso tornará sua vida muito mais simples.