No Nautilus (a instalação padrão do Ubuntu), há uma opção para desativar miniaturas. Talvez você tenha desligado? Abra um gerenciador de arquivos e vá para Edit > Preferências > "Visualizar" > Outros arquivos visualizáveis > Mostrar miniaturas: somente arquivos locais.
Se isso não funcionar, você pode tentar limpar o conteúdo de ~ / .thumbnails