Clique com o botão direito em qualquer arquivo que você deseja que seu tipo abra com o Totem e selecione Propriedades Ao lado da linha "Tipo:", você verá o ícone de configurações que diz Editar tipo de arquivo quando você passa o mouse sobre ele. Clique nele e você verá a lista de aplicativos na metade inferior, mova o Totem ou adicione-o, caso não seja mostrado.
OK, feche, pronto para todos os tipos de arquivo.