As janelas instáveis não são do Gnome, mas do gerenciador de janelas, por exemplo. Compiz. O gerenciador de janelas em Gnome Shell é Mutter. e isso não suporta Windows Wobbly (ainda). Existe uma extensão do Gnome Shell na versão beta que permite obter um efeito de janela instável. Isso parece estar com bugs atualmente e é apenas um beta.