Gostaria de inicializar no modo de recuperação e ir para o shell de root, então faça:
Backup da pasta antiga:
mv /home/youruser /home/youruser-backup
Crie uma nova pasta 'home' para o seu usuário
mkdir /home/youruser
Defina o acesso de leitura / gravação correto
chown youruser:youruser /home/youruser
Reinicializar o sistema
shutdown -r now
Isso forneceria uma pasta vazia para o usuário padrão antigo. Você deve poder fazer o login e copiar seus arquivos importantes de volta do seu usuário-backup para o seu usuário.